Православная церковь имени Святого Пророка Предтечи и Крестителя Иоанна с приделами князя Владимира и Архиепископа Мирликийского Николая Чудотворца была заложена в Москве на Хованском кладбище 18 августа 1994 года епископом Орехово-Зуевским Алексием. Поэтому этот храм – один из самых молодых, выросших после падения Советского Союза.
При закладке фундамента, в основание здания церкви Иоанна Предтечи на Хованском кладбище был заложен камень из купели, в которой, согласно преданию, был крещен святитель равноапостольный князь Владимир. Само строящееся здание храма приписано к собору Архангела Михаила в Тропареве. Сегодня церковь Иоанна Предтечи на Хованском кладбище - это большое кирпичное многошатровое строение на одном из крупнейших некрополей города Москвы.

Силами прихожан по благословению Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Алексия II при соборе была построена часовня иконы Владимирской Божьей матери, в которой в настоящее время проводятся церковные службы и религиозные обряды.